40 elt została powołana na podstawie Rozkazu Dowódcy WLOP Nr 0142 z dnia 23 sierpnia 1999 roku wyniku rozformowania 40. pułku lotnictwa myśliwsko-bombowego
w Świdwinie.

Funkcjonować zaczęła od 1 stycznia 2000 roku. Kontynuuje tradycje 40. plmb, z którego wywodzi się większość pilotów i personelu technicznego. Eskadra stacjonuje na lotnisku Świdwin, a organizacyjnie wchodzi w skład 1. Brygady Lotnictwa Taktycznego.

40. pułk sformowano w październiku 1951 roku w Krakowie, na bazie eskadry wydzielonej
z 2. pułku lotnictwa myśliwskiego, i nadano mu nazwę 40. pułku lotnictwa myśliwskiego.

W lutym 1952 roku pułk został przebazowany do Mierzęcice, a w styczniu 1953 roku do Świdwina. W 1971 roku 40. plm przemianowano na 40. pułk lotnictwa myśliwsko-szturmowego, a w 1982 roku na 40. pułk lotnictwa myśliwsko-bombowego. 23 sierpnia 1999 roku rozformowano 40. plmb na ich bazie sformowano 39. elt, 40. elt i 11 Bazę Lotniczą w Świdwinie.

W uzbrojeniu jednostki znajdowały się samoloty: Po-2, Jak-11, Jak-23, MiG-15, Lim-2,
Lim-5, MiG-17PF, MiG-21, Lim-6, Su-22M4.

40. eskadra lotnictwa taktycznego jest eskadrą Sił Niskiej Gotowości. Dysponuje samolotami Su-22M4 oraz TS-11 Iskra.

Zasadniczymi przedsięwzięciami szkolenia eskadry są:

-    udział w ćwiczeniach lotniczych w kraju i za granicą,

Dowódcy 40 elt

Kpt.. pil. Cezary Wasser                          23.08.1999-01.09.2002

Mjr.. pil. Mirosław Tomaszewski              01.09.2002-04.02.2004

Mjr. pil. Wojciech Maniewski                   04.02.2004-01.07.2004  Pełnił obowiązki czasowo

Kpt. pil. Dariusz Maciąg                           01.07.2004-02.10.2006

Mjr. pil. Wojciech Maniewski                   02.10.2006-23.01.2008

Mjr. pil. Robert Kantowicz                       24.01.2008-25.05.2008  Pełnił obowiązki czasowo

Ppłk. pil. Ireneusz Łyczek                         25.05.2008 do chwili obecnej

Ćwiczenia w których brała udział eskadra:

Rok 2001:

"Chopin-2001" w kwietniu we Francji w Saint-Dizier z Jaguarami E

"Adax-2001"

 Rok 2002:

"Strong Resolve 2002" od 01-15.03 do Świdwina przyleciały Sea Hariery FA2 z 801 eskadry Royal Navy z bazy Yeovilton w Somerset

"Clean Hunter"

"Lone Kestrel 2002" od 30.08-09.09

16-27.09 Przyleciały do Świdwina Mirage 2000N z EC3/4 "Limousin" z Istres

Rok 2003

"Szybka Mewa"

"NAM"

Rok 2004

"Polish  Dancer 04"  przyleciały do Świdwina Hariery z 801 eskadry

"Clean Hunter 2004" ćwiczyliśmy w Niemczech w 33 Bazie Lotniczej w Buchel

"Chopin-2004" od 15-22.10 ćwiczyliśmy we Francji w eskadrze "Normandia-Niemen" razem z Mirage F1

"Kondor 2004"

"Passex"

 Rok 2005

"Sentry White Falcon 2005" 02-17.06 ćwiczenia w 31 Bazie Lotniczej na Krzesinach